Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCIP41743 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCIP41743 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms