Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGM1P36871 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGM1P36871 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGM1P36871 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGM1P36871 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGM1P36871 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGM1P36871 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGM1P36871 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGM1P36871 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGM1P36871 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGM1P36871 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGM1P36871 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGM1P36871 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGM1P36871 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGM1P36871 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGM1P36871 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGM1P36871 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGM1P36871 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGM1P36871 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGM1P36871 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGM1P36871 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGM1P36871 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGM1P36871 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGM1P36871 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGM1P36871 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGM1P36871 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGM1P36871 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGM1P36871 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PGM1P36871 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PGM1P36871 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGM1P36871 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGM1P36871 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGM1P36871 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGM1P36871 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGM1P36871 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGM1P36871 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGM1P36871 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGM1P36871 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGM1P36871 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGM1P36871 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGM1P36871 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGM1P36871 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGM1P36871 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGM1P36871 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGM1P36871 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGM1P36871 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGM1P36871 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGM1P36871 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGM1P36871 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGM1P36871 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGM1P36871 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGM1P36871 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGM1P36871 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGM1P36871 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGM1P36871 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PGM1P36871 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGM1P36871 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGM1P36871 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGM1P36871 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGM1P36871 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGM1P36871 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PGM1P36871 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGM1P36871 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGM1P36871 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGM1P36871 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms