Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT2P35908 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT2P35908 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT2P35908 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT2P35908 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT2P35908 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT2P35908 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT2P35908 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT2P35908 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT2P35908 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT2P35908 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT2P35908 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT2P35908 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT2P35908 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT2P35908 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT2P35908 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT2P35908 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT2P35908 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT2P35908 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT2P35908 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT2P35908 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT2P35908 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT2P35908 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT2P35908 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT2P35908 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT2P35908 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT2P35908 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT2P35908 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT2P35908 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT2P35908 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT2P35908 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT2P35908 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT2P35908 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT2P35908 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT2P35908 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT2P35908 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT2P35908 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT2P35908 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT2P35908 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT2P35908 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT2P35908 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT2P35908 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT2P35908 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT2P35908 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT2P35908 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT2P35908 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT2P35908 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT2P35908 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT2P35908 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT2P35908 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT2P35908 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT2P35908 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT2P35908 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT2P35908 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT2P35908 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT2P35908 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT2P35908 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KRT2P35908 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms