Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMB4P28070 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSMB4P28070 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSMB4P28070 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms