Protein–RNA interactions for Protein: P26373

RPL13, 60S ribosomal protein L13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13P26373 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPL13P26373 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL13P26373 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL13P26373 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL13P26373 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPL13P26373 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL13P26373 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPL13P26373 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL13P26373 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL13P26373 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL13P26373 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL13P26373 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL13P26373 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL13P26373 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL13P26373 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPL13P26373 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL13P26373 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL13P26373 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL13P26373 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL13P26373 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPL13P26373 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL13P26373 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL13P26373 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL13P26373 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL13P26373 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPL13P26373 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL13P26373 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL13P26373 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL13P26373 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL13P26373 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL13P26373 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPL13P26373 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPL13P26373 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL13P26373 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL13P26373 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL13P26373 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL13P26373 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL13P26373 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPL13P26373 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL13P26373 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPL13P26373 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL13P26373 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL13P26373 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL13P26373 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL13P26373 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL13P26373 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL13P26373 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL13P26373 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPL13P26373 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPL13P26373 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL13P26373 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL13P26373 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL13P26373 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL13P26373 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL13P26373 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPL13P26373 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL13P26373 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL13P26373 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL13P26373 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL13P26373 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPL13P26373 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL13P26373 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPL13P26373 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL13P26373 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL13P26373 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL13P26373 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL13P26373 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL13P26373 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL13P26373 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPL13P26373 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL13P26373 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL13P26373 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL13P26373 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPL13P26373 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL13P26373 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL13P26373 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL13P26373 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL13P26373 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPL13P26373 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL13P26373 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPL13P26373 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms