Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA4P22748 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA4P22748 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CA4P22748 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA4P22748 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA4P22748 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA4P22748 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA4P22748 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA4P22748 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CA4P22748 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CA4P22748 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA4P22748 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA4P22748 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CA4P22748 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA4P22748 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA4P22748 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CA4P22748 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA4P22748 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CA4P22748 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA4P22748 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CA4P22748 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CA4P22748 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CA4P22748 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA4P22748 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CA4P22748 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA4P22748 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA4P22748 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA4P22748 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA4P22748 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CA4P22748 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA4P22748 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA4P22748 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA4P22748 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA4P22748 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA4P22748 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CA4P22748 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA4P22748 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA4P22748 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA4P22748 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA4P22748 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CA4P22748 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA4P22748 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA4P22748 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA4P22748 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CA4P22748 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA4P22748 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA4P22748 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA4P22748 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA4P22748 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA4P22748 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA4P22748 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA4P22748 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA4P22748 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CA4P22748 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA4P22748 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CA4P22748 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CA4P22748 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA4P22748 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA4P22748 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA4P22748 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CA4P22748 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA4P22748 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CA4P22748 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA4P22748 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA4P22748 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA4P22748 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA4P22748 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA4P22748 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA4P22748 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA4P22748 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA4P22748 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CA4P22748 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CA4P22748 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA4P22748 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA4P22748 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA4P22748 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA4P22748 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA4P22748 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CA4P22748 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms