Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKIP12755 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKIP12755 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKIP12755 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SKIP12755 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIP12755 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIP12755 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIP12755 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIP12755 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKIP12755 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIP12755 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIP12755 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIP12755 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIP12755 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIP12755 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIP12755 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKIP12755 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIP12755 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIP12755 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIP12755 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIP12755 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKIP12755 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIP12755 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIP12755 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIP12755 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKIP12755 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIP12755 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIP12755 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIP12755 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIP12755 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIP12755 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKIP12755 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIP12755 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIP12755 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIP12755 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIP12755 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIP12755 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIP12755 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKIP12755 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SKIP12755 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIP12755 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIP12755 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIP12755 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SKIP12755 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIP12755 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIP12755 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKIP12755 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIP12755 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIP12755 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIP12755 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIP12755 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIP12755 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIP12755 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIP12755 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKIP12755 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKIP12755 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIP12755 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKIP12755 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIP12755 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIP12755 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIP12755 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIP12755 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIP12755 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIP12755 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIP12755 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIP12755 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKIP12755 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SKIP12755 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIP12755 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SKIP12755 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIP12755 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIP12755 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIP12755 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIP12755 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SKIP12755 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SKIP12755 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SKIP12755 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms