Protein–RNA interactions for Protein: P11309

PIM1, Serine/threonine-protein kinase pim-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM1P11309 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIM1P11309 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIM1P11309 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIM1P11309 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIM1P11309 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIM1P11309 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIM1P11309 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIM1P11309 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIM1P11309 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIM1P11309 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIM1P11309 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIM1P11309 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIM1P11309 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIM1P11309 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIM1P11309 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIM1P11309 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIM1P11309 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIM1P11309 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIM1P11309 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIM1P11309 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIM1P11309 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIM1P11309 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIM1P11309 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIM1P11309 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIM1P11309 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIM1P11309 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIM1P11309 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIM1P11309 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIM1P11309 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIM1P11309 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIM1P11309 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIM1P11309 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIM1P11309 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIM1P11309 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIM1P11309 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIM1P11309 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIM1P11309 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIM1P11309 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIM1P11309 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIM1P11309 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIM1P11309 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIM1P11309 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIM1P11309 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIM1P11309 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIM1P11309 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIM1P11309 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIM1P11309 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIM1P11309 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIM1P11309 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIM1P11309 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIM1P11309 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIM1P11309 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIM1P11309 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIM1P11309 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIM1P11309 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIM1P11309 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIM1P11309 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIM1P11309 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIM1P11309 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIM1P11309 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIM1P11309 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIM1P11309 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIM1P11309 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIM1P11309 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIM1P11309 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIM1P11309 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIM1P11309 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIM1P11309 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIM1P11309 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIM1P11309 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIM1P11309 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIM1P11309 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms