Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSF1P09603 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSF1P09603 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF1P09603 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF1P09603 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF1P09603 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF1P09603 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF1P09603 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF1P09603 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF1P09603 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSF1P09603 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF1P09603 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF1P09603 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF1P09603 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF1P09603 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF1P09603 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF1P09603 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSF1P09603 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF1P09603 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF1P09603 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF1P09603 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSF1P09603 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF1P09603 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF1P09603 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF1P09603 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF1P09603 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF1P09603 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF1P09603 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSF1P09603 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSF1P09603 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSF1P09603 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSF1P09603 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSF1P09603 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSF1P09603 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF1P09603 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF1P09603 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF1P09603 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF1P09603 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF1P09603 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF1P09603 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF1P09603 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSF1P09603 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSF1P09603 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSF1P09603 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSF1P09603 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSF1P09603 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSF1P09603 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSF1P09603 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSF1P09603 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSF1P09603 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSF1P09603 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSF1P09603 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSF1P09603 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSF1P09603 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSF1P09603 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSF1P09603 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSF1P09603 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms