Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB1P08034 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB1P08034 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB1P08034 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB1P08034 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB1P08034 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB1P08034 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB1P08034 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB1P08034 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB1P08034 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB1P08034 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB1P08034 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB1P08034 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB1P08034 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB1P08034 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB1P08034 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB1P08034 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB1P08034 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB1P08034 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB1P08034 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJB1P08034 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB1P08034 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB1P08034 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB1P08034 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB1P08034 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB1P08034 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB1P08034 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJB1P08034 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB1P08034 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB1P08034 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB1P08034 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB1P08034 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB1P08034 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB1P08034 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB1P08034 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJB1P08034 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GJB1P08034 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB1P08034 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB1P08034 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB1P08034 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB1P08034 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB1P08034 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB1P08034 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GJB1P08034 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB1P08034 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB1P08034 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GJB1P08034 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GJB1P08034 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB1P08034 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB1P08034 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB1P08034 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB1P08034 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB1P08034 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB1P08034 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GJB1P08034 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB1P08034 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB1P08034 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GJB1P08034 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB1P08034 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB1P08034 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB1P08034 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB1P08034 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB1P08034 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB1P08034 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJB1P08034 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB1P08034 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB1P08034 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB1P08034 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJB1P08034 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB1P08034 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB1P08034 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJB1P08034 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB1P08034 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB1P08034 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB1P08034 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB1P08034 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB1P08034 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB1P08034 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB1P08034 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJB1P08034 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB1P08034 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB1P08034 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB1P08034 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJB1P08034 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB1P08034 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB1P08034 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB1P08034 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB1P08034 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJB1P08034 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms