Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf47O95873 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C6orf47O95873 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C6orf47O95873 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms