Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNTO95613 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNTO95613 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNTO95613 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNTO95613 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNTO95613 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNTO95613 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNTO95613 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PCNTO95613 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCNTO95613 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PCNTO95613 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PCNTO95613 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCNTO95613 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNTO95613 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNTO95613 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNTO95613 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNTO95613 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNTO95613 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNTO95613 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNTO95613 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNTO95613 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCNTO95613 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PCNTO95613 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCNTO95613 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCNTO95613 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCNTO95613 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCNTO95613 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCNTO95613 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCNTO95613 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCNTO95613 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCNTO95613 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCNTO95613 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCNTO95613 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCNTO95613 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCNTO95613 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNTO95613 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNTO95613 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCNTO95613 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNTO95613 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNTO95613 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNTO95613 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNTO95613 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNTO95613 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNTO95613 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCNTO95613 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCNTO95613 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCNTO95613 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCNTO95613 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCNTO95613 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNTO95613 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNTO95613 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNTO95613 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNTO95613 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNTO95613 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNTO95613 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNTO95613 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PCNTO95613 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCNTO95613 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCNTO95613 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCNTO95613 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCNTO95613 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNTO95613 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNTO95613 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNTO95613 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNTO95613 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNTO95613 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNTO95613 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCNTO95613 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCNTO95613 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCNTO95613 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCNTO95613 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCNTO95613 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCNTO95613 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCNTO95613 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCNTO95613 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNTO95613 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNTO95613 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNTO95613 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNTO95613 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNTO95613 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNTO95613 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCNTO95613 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNTO95613 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNTO95613 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNTO95613 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNTO95613 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCNTO95613 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCNTO95613 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCNTO95613 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCNTO95613 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCNTO95613 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCNTO95613 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCNTO95613 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCNTO95613 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCNTO95613 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCNTO95613 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PCNTO95613 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCNTO95613 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCNTO95613 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCNTO95613 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms