Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTDNEP1O95476 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1O95476 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTDNEP1O95476 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms