Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAPBO95292 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAPBO95292 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAPBO95292 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAPBO95292 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAPBO95292 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VAPBO95292 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAPBO95292 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAPBO95292 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAPBO95292 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAPBO95292 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAPBO95292 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAPBO95292 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAPBO95292 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAPBO95292 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAPBO95292 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAPBO95292 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAPBO95292 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VAPBO95292 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAPBO95292 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAPBO95292 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAPBO95292 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAPBO95292 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAPBO95292 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAPBO95292 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAPBO95292 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAPBO95292 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPBO95292 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAPBO95292 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VAPBO95292 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAPBO95292 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAPBO95292 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAPBO95292 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAPBO95292 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAPBO95292 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAPBO95292 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAPBO95292 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAPBO95292 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAPBO95292 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAPBO95292 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAPBO95292 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAPBO95292 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAPBO95292 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPBO95292 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPBO95292 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPBO95292 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPBO95292 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPBO95292 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPBO95292 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPBO95292 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPBO95292 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPBO95292 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPBO95292 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPBO95292 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPBO95292 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPBO95292 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPBO95292 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPBO95292 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPBO95292 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPBO95292 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPBO95292 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPBO95292 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPBO95292 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPBO95292 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPBO95292 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPBO95292 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPBO95292 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPBO95292 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPBO95292 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPBO95292 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPBO95292 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAPBO95292 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAPBO95292 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAPBO95292 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAPBO95292 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAPBO95292 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAPBO95292 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAPBO95292 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAPBO95292 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
VAPBO95292 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAPBO95292 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAPBO95292 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VAPBO95292 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAPBO95292 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPBO95292 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPBO95292 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPBO95292 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPBO95292 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPBO95292 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242.5 ms