Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CILPO75339 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CILPO75339 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CILPO75339 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CILPO75339 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CILPO75339 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CILPO75339 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CILPO75339 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CILPO75339 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CILPO75339 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CILPO75339 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CILPO75339 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CILPO75339 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CILPO75339 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CILPO75339 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CILPO75339 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CILPO75339 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CILPO75339 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CILPO75339 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CILPO75339 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CILPO75339 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CILPO75339 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CILPO75339 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CILPO75339 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CILPO75339 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CILPO75339 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CILPO75339 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CILPO75339 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CILPO75339 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CILPO75339 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CILPO75339 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CILPO75339 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CILPO75339 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CILPO75339 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CILPO75339 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CILPO75339 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CILPO75339 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CILPO75339 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CILPO75339 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CILPO75339 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CILPO75339 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CILPO75339 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CILPO75339 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CILPO75339 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CILPO75339 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CILPO75339 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CILPO75339 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CILPO75339 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CILPO75339 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CILPO75339 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CILPO75339 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CILPO75339 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CILPO75339 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CILPO75339 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CILPO75339 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CILPO75339 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CILPO75339 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CILPO75339 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CILPO75339 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CILPO75339 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CILPO75339 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CILPO75339 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CILPO75339 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CILPO75339 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CILPO75339 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CILPO75339 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CILPO75339 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CILPO75339 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CILPO75339 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CILPO75339 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CILPO75339 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CILPO75339 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CILPO75339 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CILPO75339 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CILPO75339 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms