Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPLO60437 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPLO60437 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PPLO60437 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPLO60437 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPLO60437 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PPLO60437 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPLO60437 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PPLO60437 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PPLO60437 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPLO60437 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPLO60437 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPLO60437 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPLO60437 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPLO60437 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PPLO60437 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPLO60437 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PPLO60437 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPLO60437 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PPLO60437 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PPLO60437 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPLO60437 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PPLO60437 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPLO60437 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPLO60437 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PPLO60437 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPLO60437 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPLO60437 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PPLO60437 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PPLO60437 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPLO60437 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PPLO60437 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPLO60437 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPLO60437 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPLO60437 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPLO60437 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPLO60437 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPLO60437 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPLO60437 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PPLO60437 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPLO60437 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPLO60437 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PPLO60437 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPLO60437 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPLO60437 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPLO60437 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PPLO60437 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PPLO60437 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PPLO60437 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPLO60437 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPLO60437 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPLO60437 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPLO60437 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPLO60437 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PPLO60437 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PPLO60437 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPLO60437 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPLO60437 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PPLO60437 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPLO60437 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPLO60437 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPLO60437 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPLO60437 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPLO60437 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PPLO60437 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPLO60437 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPLO60437 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPLO60437 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PPLO60437 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPLO60437 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PPLO60437 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PPLO60437 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PPLO60437 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPLO60437 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPLO60437 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPLO60437 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPLO60437 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPLO60437 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPLO60437 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPLO60437 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PPLO60437 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PPLO60437 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PPLO60437 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PPLO60437 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PPLO60437 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PPLO60437 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PPLO60437 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPLO60437 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PPLO60437 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPLO60437 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms