Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDB2O43679 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDB2O43679 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDB2O43679 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDB2O43679 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LDB2O43679 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDB2O43679 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDB2O43679 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDB2O43679 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDB2O43679 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDB2O43679 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDB2O43679 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDB2O43679 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LDB2O43679 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDB2O43679 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDB2O43679 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDB2O43679 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDB2O43679 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDB2O43679 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDB2O43679 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDB2O43679 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDB2O43679 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDB2O43679 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LDB2O43679 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LDB2O43679 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LDB2O43679 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LDB2O43679 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDB2O43679 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDB2O43679 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LDB2O43679 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDB2O43679 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDB2O43679 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDB2O43679 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDB2O43679 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDB2O43679 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDB2O43679 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDB2O43679 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LDB2O43679 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDB2O43679 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDB2O43679 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDB2O43679 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDB2O43679 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDB2O43679 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDB2O43679 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDB2O43679 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDB2O43679 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDB2O43679 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDB2O43679 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDB2O43679 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDB2O43679 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDB2O43679 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDB2O43679 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDB2O43679 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDB2O43679 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDB2O43679 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDB2O43679 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDB2O43679 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDB2O43679 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LDB2O43679 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDB2O43679 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDB2O43679 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDB2O43679 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDB2O43679 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDB2O43679 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDB2O43679 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDB2O43679 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDB2O43679 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDB2O43679 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LDB2O43679 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDB2O43679 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDB2O43679 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDB2O43679 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDB2O43679 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDB2O43679 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDB2O43679 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDB2O43679 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDB2O43679 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDB2O43679 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDB2O43679 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LDB2O43679 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LDB2O43679 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB2O43679 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB2O43679 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB2O43679 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LDB2O43679 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms