Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXN3O00409 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXN3O00409 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXN3O00409 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms