Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMD12O00232 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMD12O00232 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMD12O00232 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms