Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H7C0S8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0S8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0S8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0S8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0S8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0S8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0S8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0S8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0S8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0S8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0S8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0S8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0S8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0S8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0S8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0S8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0S8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0S8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0S8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0S8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0S8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0S8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0S8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0S8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0S8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0S8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0S8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0S8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0S8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H7C0S8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H7C0S8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H7C0S8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H7C0S8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H7C0S8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H7C0S8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H7C0S8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H7C0S8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H7C0S8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H7C0S8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H7C0S8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H7C0S8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H7C0S8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H7C0S8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H7C0S8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H7C0S8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H7C0S8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H7C0S8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H7C0S8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H7C0S8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H7C0S8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H7C0S8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H7C0S8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H7C0S8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H7C0S8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H7C0S8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H7C0S8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H7C0S8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H7C0S8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H7C0S8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H7C0S8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H7C0S8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H7C0S8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
H7C0S8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H7C0S8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H7C0S8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms