Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01549A6NIU2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms