Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM49BA6NDI0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM49BA6NDI0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM49BA6NDI0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM49BA6NDI0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms