Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYCE3A1L190 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYCE3A1L190 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms