Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms