Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPG1Q9Y678 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPG1Q9Y678 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COPG1Q9Y678 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms