Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC13A4Q9UKG4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC13A4Q9UKG4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC13A4Q9UKG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms