Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC23Q9UJX2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC23Q9UJX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC23Q9UJX2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms