Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCP2D1Q9UJQ7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms