Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC3Q9UHC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC3Q9UHC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ASIC3Q9UHC3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms