Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VTI1BQ9UEU0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VTI1BQ9UEU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms