Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCNK4Q9NYG8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNK4Q9NYG8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms