Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCND1Q9NSA2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCND1Q9NSA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCND1Q9NSA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KCND1Q9NSA2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms