Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHST12Q9NRB3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHST12Q9NRB3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST12Q9NRB3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST12Q9NRB3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms