Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MID1IP1Q9NPA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MID1IP1Q9NPA3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MID1IP1Q9NPA3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms