Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCSER2Q9H7U1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCSER2Q9H7U1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCSER2Q9H7U1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms