Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GFRA4Q9GZZ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GFRA4Q9GZZ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GFRA4Q9GZZ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms