Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC27Q9C0I9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
LRRC27Q9C0I9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC27Q9C0I9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
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