Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
THSD7BQ9C0I4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
THSD7BQ9C0I4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
THSD7BQ9C0I4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
THSD7BQ9C0I4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms