Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM9Q9C026 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM9Q9C026 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM9Q9C026 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms