Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHCBP1LQ9BZQ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHCBP1LQ9BZQ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SHCBP1LQ9BZQ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.7 ms