Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COL25A1Q9BXS0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL25A1Q9BXS0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
COL25A1Q9BXS0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COL25A1Q9BXS0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms