Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MESP1Q9BRJ9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MESP1Q9BRJ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MESP1Q9BRJ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MESP1Q9BRJ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms