Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRRT1Q99946 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PRRT1Q99946 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PRRT1Q99946 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.6 ms