Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GPA33Q99795 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPA33Q99795 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPA33Q99795 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms