Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SEC62Q99442 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SEC62Q99442 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SEC62Q99442 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms