Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC12Q96J65 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCC12Q96J65 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCC12Q96J65 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCC12Q96J65 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms