Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
BCANQ96GW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
BCANQ96GW7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.66■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
BCANQ96GW7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
BCANQ96GW7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms