Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALML4Q96GE6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CALML4Q96GE6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALML4Q96GE6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALML4Q96GE6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms