Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MFSD3Q96ES6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MFSD3Q96ES6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MFSD3Q96ES6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms