Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARRDC3Q96B67 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARRDC3Q96B67 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARRDC3Q96B67 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms